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小心Trizol影响你的miRNA实验结果!

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TRIzol影响实验结果?miRNA文章被撤回


【字体: 时间:2012年07月16日 来源:生物通

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  韩国首尔大学的科学家Narry Kim(金娜蕊)及其研究小组近日撤回了一篇关于microRNA(miRNA)衰减的文章,因为她们发现,所用的TRIzol试剂会对富含GC的miRNA或具二级结构的miRNA产生不同影响。

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  韩国首尔大学的科学家Narry Kim(金娜蕊)及其研究小组近日撤回了一篇关于microRNA(miRNA)衰减的文章,因为她们发现,所用的TRIzol试剂会对富含GC的miRNA或具二级结构的miRNA产生不同影响。

此外,Kim及她的同事还发表了新的数据,将TRIzol RNA分离方法与另一种不太常用的mirVana方法进行了比较,应用在高密度和低密度细胞样品上。利用TRIzol,她们发现,低密度培养物中的miR-141水平低于高密度培养物。然而,利用mirVana方法,两者只有轻微的差异。

作者认为,两个操作步骤的数据不一致提出了一个严重的问题,即某些miRNA可能在RNA制备过程中丢失,这取决于选择的操作步骤。

Kim谈道:“科学家不可避免地会承认一些假设,而它们后来被证明是错误的。我们也存在一些技术限制,而在研究的时候未被发现。因此,得出错误的结论有时是不可避免的。最重要的是要诚实,一旦我们意识到,就要纠正错误。”

对于miRNA的分离,很多实验室都是使用TRIzol试剂。但从这篇文章的结论来看,TRIzol很可能会影响部分实验结果。吸取Narry Kim的教训,大家最好还是采用两种分离方法,来验证结果的可靠性。同时,希望Life Tech的研发部门好好研究一下,发布更为可靠的操作步骤。(生物通 薄荷)

原文

Retraction Notice to: Cell Adhesion-Dependent Control of MicroRNA Decay

(Molecular Cell 43, 1005–1014; September 16, 2011)

In this paper, we reported that the levels of specific microRNAs (miRNAs) decrease when cells are grown at low density or when cells are detached from a culture dish. Based on our results, we proposed that some miRNAs are selectively destabilized depending on the adhesion status of the cells. However, in subsequent studies, we discovered that structured miRNAs with low GC content, such as miR-141, miR-29b, miR-21, miR-106b, miR-15a, and miR-34a, are selectively lost during sample preparation rather than degraded in the cell. The small RNA loss occurs when a small number of cells is used for RNA preparation using the standard TRIzol protocol (see Kim et al. [pp. 893–895] in this issue for details). These findings provide an alternative explanation for our original data. While the original data are all reproducible, we are retracting the paper because we feel the main conclusions have been compromised. We apologize for any inconvenience this may have caused.